Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp16Q99LG0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms