Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtcbQ99LF4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtcbQ99LF4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms