Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lysmd3Q99LE3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lysmd3Q99LE3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms