Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DhddsQ99KU1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DhddsQ99KU1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms