Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmp1Q99KU0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms