Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms