Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms