Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcf19Q99KJ5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf19Q99KJ5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms