Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp11Q99K46 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms