Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms