Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krcc1Q99JT5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms