Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ddb2Q99J79 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ddb2Q99J79 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ddb2Q99J79 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ddb2Q99J79 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ddb2Q99J79 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ddb2Q99J79 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ddb2Q99J79 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ddb2Q99J79 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ddb2Q99J79 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ddb2Q99J79 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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