Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CsprsQ99388 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms