Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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