Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms