Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Sh3bp4Q921I6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Sh3bp4Q921I6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Sh3bp4Q921I6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp4Q921I6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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