Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms