Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpe65Q91ZQ5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms