Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms