Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx15Q91WE1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms