Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms