Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms