Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK0

Tmem30a, Cell cycle control protein 50A, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30aQ8VEK0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem30aQ8VEK0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem30aQ8VEK0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem30aQ8VEK0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Tmem30aQ8VEK0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem30aQ8VEK0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms