Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71Q8VEG0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc71Q8VEG0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 279.7 ms