Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Smg8Q8VE18 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Smg8Q8VE18 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Smg8Q8VE18 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Smg8Q8VE18 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Smg8Q8VE18 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Smg8Q8VE18 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Smg8Q8VE18 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg8Q8VE18 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg8Q8VE18 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms