Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam20bQ8VCS3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms