Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn4Q8VCH8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms