Protein–RNA interactions for Protein: Q8R268

Vmn1r212, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r212Q8R268 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r212Q8R268 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms