Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rdh16f2Q8K3M1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rdh16f2Q8K3M1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rdh16f2Q8K3M1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rdh16f2Q8K3M1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rdh16f2Q8K3M1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rdh16f2Q8K3M1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rdh16f2Q8K3M1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rdh16f2Q8K3M1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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