Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms