Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c1Q8K284 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms