Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sde2Q8K1J5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms