Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33aQ8K0Y2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt33aQ8K0Y2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms