Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms