Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms