Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Brf1Q8CFK2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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