Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms