Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms