Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RybpQ8CCI5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms