Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacnb2Q8CC27 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms