Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb1Q8CBF3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Ephb1Q8CBF3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb1Q8CBF3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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