Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slfn5Q8CBA2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slfn5Q8CBA2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slfn5Q8CBA2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slfn5Q8CBA2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slfn5Q8CBA2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slfn5Q8CBA2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms