Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrbnQ8C7D2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrbnQ8C7D2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms