Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb2Q8C5Z3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb2Q8C5Z3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ssxb2Q8C5Z3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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