Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc60Q8C4J0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms