Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXZ0

Ctxn3, Cortexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn3Q8BXZ0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctxn3Q8BXZ0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms