Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tnfsfm13Q8BXS2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tnfsfm13Q8BXS2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tnfsfm13Q8BXS2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tnfsfm13Q8BXS2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tnfsfm13Q8BXS2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tnfsfm13Q8BXS2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tnfsfm13Q8BXS2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tnfsfm13Q8BXS2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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