Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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