Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms