Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms